Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps3P62908 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms