Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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