Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms