Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms