Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms