Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps18P62270 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps18P62270 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms