Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms