Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms