Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms