Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ActbP60710 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ActbP60710 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ActbP60710 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ActbP60710 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ActbP60710 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ActbP60710 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms