Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ythdf1P59326 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ythdf1P59326 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms