Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms