Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms