Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtskP55097 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtskP55097 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtskP55097 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms