Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aqp4P55088 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aqp4P55088 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms