Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fdft1P53798 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms