Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lbx1P52955 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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