Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efna1P52793 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms