Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox5P52651 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms