Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e3P52483 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e3P52483 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms