Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr1cP52432 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms