Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pold1P52431 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pold1P52431 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pold1P52431 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pold1P52431 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms