Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ClgnP52194 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms