Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccr4P51680 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr4P51680 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms