Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr3P51678 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr3P51678 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms