Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Defa6P50704 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Defa6P50704 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms