Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms