Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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BckdhaP50136 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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BckdhaP50136 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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BckdhaP50136 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms