Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GdnfP48540 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms