Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms