Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl5P47962 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms