Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pax7P47239 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pax7P47239 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms