Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtgfrP43117 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms