Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NodalP43021 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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