Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms