Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Elk1P41969 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Elk1P41969 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms