Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TfamP40630 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TfamP40630 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TfamP40630 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TfamP40630 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TfamP40630 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms