Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf2P39429 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Traf2P39429 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms