Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col18a1P39061 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms