Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtlP38585 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtlP38585 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms