Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Grin1P35438 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms