Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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