Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pola1P33609 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms