Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gsx1P31315 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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