Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc10P31257 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms