Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa2P31245 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms