Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VtnP29788 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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VtnP29788 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VtnP29788 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VtnP29788 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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VtnP29788 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VtnP29788 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VtnP29788 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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VtnP29788 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VtnP29788 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VtnP29788 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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