Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxrgP28705 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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