Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hoxd10P28359 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Hoxd10P28359 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd10P28359 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms