Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa3P28310 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa3P28310 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms